Samurai 3

ブロック全体を撮る必要はありません。
必要な場所だけを撮る。

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スクロール

Samurai 3 Studio

撮像から
処理まで。

パイプラインはひとつ。Studio は各サイクル内のタイルを揃え、サイクル同士も揃え、スタック全体のコントラストと明るさを合わせ、3D でレンダリングし、自分で学習させた分類器でセグメンテーションします。すべて Samurai 3 の中で。

ライブデモ

ご自身で動かしてみてください。

このページにあるすべて — タイル計画、タイムトラベル、オートフォーカス、Studio — は実際のソフトウェアの機能です。ブラウザで開いて、実データで操作できます。

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仕様

Samurai 3.1.0 — ソフトウェアに搭載されている機能。

撮像

  • 01任意数の関心領域 — それぞれに画素サイズ、ドウェル、タイル格子を設定
  • 02タイル単位のオン / オフ。タイムトラベルで任意のサイクルからも変更可能
  • 03タイルのオーバーラップ(任意)。ビューポートでブレンド表示
  • 04タイムトラベル — 過去または計画中の任意のサイクルを確認・編集
  • 05サイクルエンジン:有効タイルを撮像、切削、繰り返し。一時停止と再開
  • 06ドウェルのイージイン、イメージング加算(フォーカス位置まで上昇)、ナイフ発振、切片厚と切削速度

ラン制御

  • 01ヒューリスティック AF(分散、Sobel、Laplacian、外れ値除去)または SEM 内蔵 AF
  • 02オートスティグメーション
  • 03デブリ検出 — ナイフでスイープし再撮像。継続または停止
  • 042D/3D オーバーレイとマスク。microCT または描画領域からのタイルゲーティング
  • 05切削前後のスクリプティング(待機、シリアル、TCP、外部プログラム)
  • 06SQLite 永続化 — 完了したタイルはディスクへ。クラッシュ後も再開
  • 07前回の実験を復元。ラン終了時のビームオフと省電力
  • 08真空異常後のブランクフレームを拒むディテクタラッチ保護

studio

  • 01取得タイルを Studio プロジェクトへストリーム(OME-Zarr)
  • 02サイクル内のモザイクタイル位置合わせ、サイクル間のスタック位置合わせ
  • 03スタック全体でのコントラストと明るさの整合
  • 04学習可能な AI セグメンテーション — ペイント、ライブプレビュー、ボリューム全体へ適用(古典的フィルタまたは MicroSAM)
  • 05直交 XY / XZ / YZ 断面と 3D ボリュームレンダリング(OSPRay を含む)
  • 06非破壊リニエージ:コントラスト、ノイズ除去、カーテン除去、フィルタ
  • 07書き出し:フレーム、動画、メッシュ、Ilastik、TrakEM2 imagelist

モジュール

  • 01Kensho 格納式 BSED
  • 02精密帯電中和(PCN)。チップ位置のライブ追従
  • 03EDS 元素マップ(Oxford AZtec)
  • 04Studio 処理ワークベンチ

互換性

  • 01Universal SEM Bridge — TESCAN、Zeiss SmartSEM、Thermo Fisher Quanta / Nova / Apreo、Hitachi、CIQTEK、JEOL
  • 02汎用 SEM — API がない場合はフォルダ監視とスクリプティング
  • 03Katana ウルトラミクロトーム(USB)
  • 04Windows 10 以降(64 ビット)
  • 05Apple Silicon(M シリーズ)搭載 Mac の macOS
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