Samurai 3

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Samurai 3 Studio

从采集
处理

一条流水线。Studio 先对齐每个循环内部的图块,再对齐循环之间,统一整叠数据的对比度与亮度,做三维渲染,并用你自己训练的分类器完成分割——全都在 Samurai 3 里。

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本页展示的一切 —— 图块计划、时间旅行、自动对焦、Studio —— 都在软件里。在浏览器中打开,用真实数据直接操作。

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技术规格

Samurai 3.1.0 — 软件中的功能。

采集

  • 01任意数量的感兴趣区域 — 各自独立的像素尺寸、驻留时间和图块网格
  • 02按图块开关,也可通过时间旅行在任意循环上修改
  • 03可选图块重叠,并在视口中混合显示
  • 04时间旅行 — 查看并编辑任意已完成或计划中的循环
  • 05循环引擎:采集已启用图块、切片、重复;可暂停与继续
  • 06驻留缓入、成像抬升(升至对焦面)、刀振荡、切片厚度与切削速度

运行控制

  • 01启发式自动对焦(方差、Sobel、Laplacian、离群值剔除)或 SEM 内置自动对焦
  • 02自动像散校正
  • 03碎屑检测 — 扫刀后重采,继续或停止
  • 04二维/三维叠加与掩膜;由显微 CT 或手绘区域生成图块门控
  • 05每次切片前后的脚本(等待、串口、TCP、外部程序)
  • 06SQLite 持久化 — 完成的图块已写入磁盘,崩溃后可续采
  • 07恢复上一次实验;采集结束后关束并节能
  • 08真空异常后的探测器互锁保护,拒绝空白帧

studio

  • 01将已采集图块流入 Studio 项目(OME-Zarr)
  • 02循环内的拼图图块对齐;循环之间的图像栈对齐
  • 03整叠数据的对比度与亮度统一
  • 04可训练 AI 分割 — 涂绘、实时预览、跑遍整个体数据(经典滤波器或 MicroSAM)
  • 05XY / XZ / YZ 正交视图与三维体渲染(含 OSPRay)
  • 06非破坏谱系:对比度、去噪、curtain 条纹、滤波
  • 07导出:帧、视频、网格、Ilastik、TrakEM2 imagelist

模块

  • 01Kensho 可收回 BSED
  • 02精密电荷中和(PCN),针尖实时跟踪
  • 03EDS 元素图(Oxford AZtec)
  • 04Studio 处理工作台

兼容性

  • 01Universal SEM Bridge — TESCAN、Zeiss SmartSEM、Thermo Fisher Quanta / Nova / Apreo、Hitachi、CIQTEK、JEOL
  • 02通用 SEM — 无 API 时通过文件夹监视与脚本驱动
  • 03Katana 超薄切片机(USB)
  • 04Windows 10 或更高版本(64 位)
  • 05搭载 Apple Silicon(M 系列)的 Mac,macOS
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